1.水系统运行比较稳定
多联机：多联机系统内外机之间的管道内为制冷剂，换热方式为直接蒸发式。由于制冷剂在管道内的物态变化（液态变气态/气态变液态）比较复杂且频繁，容易造成有的房间过冷而有的房间却不够冷。
水系统：水系统内外机之间的管道内为循环冷冻水，换热方式为二次换热。由于水的传热性比较稳定，所以整个系统运行比较稳定。
2. 水系统除湿量小，人体舒适度高
家用空调如果长期开机，容易感觉口干舌燥，主要是由于空调在不停除湿，导致房间内湿度不够。
多联机系统：多联机系统的直接蒸发式换热和家用空调的其实是同一种换热方式，容易造成室内机除湿很厉害，人在其中工作容易疲乏不适。
水系统：水系统的二次换热，室内机换热式无需过度除湿，可以让房间内保证比较适宜的湿度，人体舒适度也很好。
3. 水系统比较节能
多联机系统：多联机系统只要外机关机，室内机就不能再进行制冷或者制热；
水系统：水系统中由于水的传热性有一定滞后，所以在下班前半小时或者一小时提前关闭主机，只保证水泵循环，都能满足室内需求。
4. 水系统容易查找故障点
多联机：多联机系统一旦系统有漏点，整个系统中的制冷剂都会全部挥发，影响整个系统使用，漏点很难查找，而且一旦漏氟对人体的伤害非常大。
水系统：水系统如果有漏点，水不会蒸发，只需要关闭故障点附近的阀门即可检修，不影响其他部分的使用。